對于人類生物學與疾病來說,了解RNA結合 在剪接過程中,不典型地編碼蛋白質的片段稱為內含子,從基因轉錄中被刪除,其余序列稱為外顯子,被重新連接。結合RNA的蛋白胨對剪接過程的控制很重要,它們結合的位置決定著RNA的哪一段在zui后的基因轉錄中被留下或刪除,在模式上與改變影片中情節(jié)的移除和插入場景,或為剪輯相同。 通過整合關于這些關鍵結合蛋白胨的大量信息,并廣泛應用這些數(shù)據(jù),這將給建立剪接預測模型和將來如胚胎干細胞一樣的其他細胞研究提供基礎。如果能了解這些蛋白如何一起發(fā)揮作用并相互影響來調節(jié)可變剪接,將為合理設計藥物提供重要的線索。 此項研究所強調的那些數(shù)據(jù)繪制出人類細胞中6個主要的核不均一核糖核蛋白胨(hnRNP)的功能性結合位點,這些數(shù)據(jù)通過全基因組方法獲得,其中全基因組方法包括定制的剪接敏感芯片、確定全基因組結合位點(CLIP-seq)的RNA測序和高通量測序。 已確定了這些hnRNP蛋白的數(shù)千計結合位點和可變剪接事件,這些蛋白令人驚訝地互相結合并互相調節(jié),其他RNA結合蛋白胨的整個網(wǎng)絡系統(tǒng)表明這些蛋白對于細胞的自身穩(wěn)定很重要。 在這項研究中,被RNA結合蛋白特異靶向的基因也經(jīng)常涉及癌癥。數(shù)以千計的遺傳突變出現(xiàn)在癌癥中,它們大部分出現(xiàn)在剪接期間被移除的內含子里面;但是,內含子區(qū)域是調節(jié)性hnRNP蛋白通常結合的位置所在。 這項研究發(fā)現(xiàn)表明了hnRNP蛋白間復雜且互為補充關系的一種的深度和它們的可能賦于細胞強壯的剪接目標。RNA結合蛋白胨的編排不僅對細胞自身穩(wěn)定很重要,也通過繪制基因上結合位點與所有調節(jié)區(qū)域的位置揭示這一過程的瓦解如何引起疾病,也可能是一種干預途徑。